Mechagodzilla City, inteligentní nanokovové město, bylo i se svými stvořiteli z planety Bilusaludo srovnáno se zemí nejmocnějším monstrem na Zemi, Godzillou. Vypadá to, že lidstvo je ztraceno…a kdesi v hlubinách vesmíru se otevře brána, a zlatá pečeť roztříští hvězdu. Tajemný Metphies, arcibiskup religiózních mimozemšťanů z planety Exif, pomalu rozsévá do myslí lidí sémě pochybností, a konvertuje je ke své vlastní víře, aby dosáhl svého konečného cíle. Godzilla se jeví jako neporazitelný, ale jen do té doby, dokud, zahalen ve zlaté záři, nesestoupí na Zemi hrůzný King Ghidorah, bytost z jiné dimenze. Celá planeta i nebesa, která ji obklopují, se třesou v průběhu boje, který transcenduje hranice času a prostoru. Má lidstvo šanci tohle vše přežít?