Děj filmu Nebudeš sám se odehrává v odlehlé horské vesnici v Makedonii v 19. století a sleduje osudy mladé dívky, která je unesena a následně přeměněna v čarodějnici prastarým duchem. Mladá čarodějnice, která je zvědavá na život v lidské podobě, nešťastnou náhodou zabije sedláka v nedaleké vesnici a poté na sebe vezme podobu své oběti, aby žila život v její kůži. Její zvědavost vzplane a ona dál ovládá tuto strašlivou moc, aby pochopila, co to znamená být člověkem.

Jedenáctiletý Cameron (David Mazouz) se znenadání začíná chovat podivně. Uzavírá se ve svém pokoji, mluví zvláštními pradávnými jazyky a vykazuje i další příznaky posedlosti. Jakmile to jeho matka (Carice van Houten) zpozoruje, spojí se s odborníky z Vatikánu, kteří za chlapcem vyšlou specialistku na podobné případy, která si na pomoc přizve Dr. Setha Embera (Aaron Eckhart) a jeho tým. Dr. Ember má totiž jedinečnou schopnost, kdy při léčbě posedlých osob vstupuje přímo do jejich mysli a v ní čelí zosobněnému zlu způsobujícímu pomatení mysli.