Eikichi Onizuka má za sebou temnou minulost vůdce motorkářského gangu. Nyní si stanovil úplně jiný cíl – stát se co nejlepším učitelem. A při té příležitosti se seznámit s mladými rozkošnými studentkami. Nejprve si však musí vydobýt respekt u svých kolegů i žáků.

Letopočet se momentálně zaseknul na čísle 2071 a zářivá budoucnost stále nikde. Lidstvo si zatím krátí čekání na světlé zítřky osidlováním Sluneční soustavy, k čemuž mu pomáhají obří teleporty umístěné na oběžných drahách. Éra kolonizace vesmíru ovšem víc než co jiného připomíná divoký západ s meziplanetárními bandity, smrtícími kráskami a pistolníky s přesnou muškou. Tímto světem líně proplouvá kosmická loď Cowboy Bebop, jejíž posádku tvoří věhlasná parta nejdrsnějších lovců odměn - bezstarostný dlouhán Spike Spiegel, ostřílený bývalý polda Jet, kráska s temnou minulostí Faye Valentine, nezletilá hackerka Ed a inteligentní pes Ein.

Tomoya Okazaki je studentem třetího ročníku střední školy, který je nespokojený se svým životem. Jeho matka zemřela při autonehodě, když byl mladší, a jeho otec se proto uchýlil k alkoholu a cigaretám. To vede k hádkám mezi nimi, až si Tomoya při rvačce poraní rameno. Od té doby má Tomoya s otcem odtažité vztahy, což způsobilo, že se z něj časem stal delikvent. Při procházce do školy potká zvláštní dívku Nagisu Furukawu, která je o rok starší, ale kvůli nemoci se opakuje. Kvůli tomu je často sama, protože většina jejích kamarádů se odstěhovala. Oba se začnou stýkat a postupem času Tomoya zjišťuje, že se jeho život pomalu posouvá novým směrem.